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1、加热均匀。由于微波作用于水分子，所以含水量高的部份，吸收微波功率多于含水量较低的部份。这就是选择性加热的特点，利用这一特点可以做到均匀加热和均匀杀青灭菌干燥。
2、微波杀青干燥高效节能。微波是直接对物料进行作用，因而没有额外的热能损失，箱内的空气与相应的容器都不会发热，所以热效率极高，生产环境也明显改善，与远红外加热相比可节电30%。
3、效率高，时间短。由于微波加热不需要热传导的过程，所以微波从不同方向穿透物体进入物体内部，由里至外使物料在很短时间内达到均匀干燥，有效地缩短了干燥时间。
4、易于控制。与常规方法相比，微波设备操作简便；传输速度可调。微波熟化设备适宜：白瓜子、黑瓜子、葵花子、西瓜子，南瓜子，瓜子仁、花生、松子、核桃仁等多种食品烘干、熟化、杀菌，烘干速度快，品质佳。
5、尤其是微波干燥灭菌设备适合各种中药材的加工处理，因微波设备独特的干燥效果及杀菌特点同时具备。经微波设备处理过后的中药材制品、中药饮片、中药粉、中药制剂、中药颗粒以及药丸、水蜜丸等都能够做到理想的干燥和灭菌效果。中药材的药效和质量会更好的保存下去。
